Для того чтобы включить очистку команд в cmd и историю открытых документов в окне недавние докумементы при выходе из системы поменяйте значения в разделе -
Раздел [HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer]
Значение "ClearRecentDocsOnExit"=dword:00000001